民國五十年組織「鹿港龍山寺修建委員會」籌備全寺重修，由鹿港街尾黃友竹擔任主任委員。重修工程由彰化縣長呂世明主持動工，初期工程歷時一年二個月，共計花費三十萬元。

此次的重修，正殿施做屋頂止漏工程，拜殿的屋頂椽木採用檜木全部換新，五門殿與戲台的六根木柱改以水泥柱加固，並修繕屋頂破損的屋瓦。山門的木柱則採抽樑換柱的方式，將靠近柱珠已腐朽的木柱更換。當時的泥水師傅為「劉訓師」（劉訓），大木匠師為水龍師（施水龍）與海師（施義海）。

民國五十二年至五十三年，重修繼續，由新林師帶領其子郭竹坡、其侄郭佛賜負責龍山寺五門殿及戲台的彩繪，油漆匠師為當時與新林師合作的「瓶師」（黃瓶、鹿港菜園人）及「金仔師」（吳金、福興同安村人）。郭新林以日薪五十元的工資施做彩繪，油漆原料向中山路同益五金行購買。彩繪枋心的書法則由新林師邀請鹿港書法家黃天素、黃世傳父子、吳東河、吳東源、歐陽錦華、王漢英等人至現場揮毫，為龍山寺留下珍貴的墨跡。

民國五十三年，全寺重修工程竣工，除東、西兩廊因缺乏經費而未加修繕外，五門殿、戲台均重新彩繪，雕樑畫棟，斧藻繽紛，氣象煥然一新。寺方並於民國五十四年，邀請朱啟南撰文「重修鹿港龍山寺記」，由黃世傳敬書，勒石立碑，以資紀念。