五門殿的龍柱為單龍蟠柱，圓形柱身，材質為花崗岩礱石，龍柱上除了雲紋、岩石雕刻外，每根龍柱各有五隻鶴飛翔其上，象徵「十全十美」。龍邊的龍柱上有一隻鶴，口啣靈芝，鶴代表長壽，靈芝則為如意的造型，取其「長壽如意」的涵意。依龍柱造型及龍山寺重修史料記錄，可判定為道光十一年（一八三一）重修時的作品。

龍柱柱身高二六十公分，直徑三十公分，柱身與柱珠接縫處置有墊片，為當年匠師調整柱身穩定平衡之用。龍柱的柱珠採圓形青斗石雕刻，柱珠上雕有花鳥瑞獸等吉祥圖案，柱珠及磉石採獨立分開，有別於山門一體成型的柱珠柱礎。

這對龍柱造型為龍邊龍身由上往下隨雲臨降，虎邊龍身由下向上翻騰，《易經》的概念中，乾為天、為陽、為上、為父，坤為地、為陰、為下、為母，這種一上一下的龍柱造型，稱為「乾坤交泰」，象徵「天地之氣交和，萬物生生不息」之意。台灣現僅有兩對此種造形的古石雕龍柱，另一對在屏東內埔天后宮的前殿。