龍山寺於道光九年至道光十一年（一八二九至一八三一）進行大規模的重修，此次修建距上次遷建已三十餘年，而此時正值鹿港商業繁榮的黃金時期。道光十一年的重修，由捐題緣金碑可知，當時官紳、船戶、舖戶，乃至泉州的商號皆共襄盛舉，參與龍山寺的重修。

此次的重修，曾任台灣府北路理番鹿港海防同知的王蘭佩捐銀四十元，張縉雲捐銀五十元，鹿港遊擊溫兆鳳捐銀四十元，官員均捐資參與鹿港龍山寺的重修，由官員的參與，可知龍山寺在民間信仰中的地位。

鹿港龍山寺為閤港廟，是鹿港地區不分地域、角頭、人群皆受民眾信奉的廟宇，因此八郊參與其重修與捐資，計有泉郊金長順捐銀八百元、廈郊金振順三百元、布郊金振萬捐銀一百四十元、染郊金合順捐銀一百二十元、敢郊金長興捐銀一百元、油郊金洪福捐銀一百元。

此外，屬於船戶、舖戶的捐資者，計有泉郊一一九家商號，捐資四百七十一元，廈郊二十五家商號，捐資七十五元，其他商號與個人共二百零一家，合計捐資四百七十六元，其他商號紛紛捐資，可惜相關資料因碑文受損而無法完全得知明細。 道光十一年（一八三一）重修龍山寺總計募得四千八百五十二元四角，花費工料費用計花費工料費用計四千六百四十二元四角，尚餘二百一十元。由於鹿港河道已淤塞，大船不能進港，所以道光年間的重修，尚需泉廈郊商的船戶協助運載材料，並負責派小船至外海接駁。

遷建後第二次的重修是咸豐二年（一八五二），距道光年間僅二十餘年，龍山寺再度面臨重修，實因道光二十八年（一八四八）彰化地區發生地震的緣故，此次重修並未有任何捐題緣金的資料，但從龍山寺的建築風格與龍柱、木雕的落款可得知，今存之拜殿建築為彼時所增建。

道光及咸豐年間的兩次重修，由於官紳之外增加了泉廈八郊商行的募資捐銀與全力配合，使龍山寺得以在豐裕的經費與資源配合下，大事修葺廟宇，增建殿堂，雕樑畫棟，完備規模；成就鹿港龍山寺至今仍領袖全台寺廟的恢弘格局。